В ночь на 20 ноября 1987 года следовавший по данному перегону грузовой поезд №2003 подъехав к светофору №3 с запрещающим показанием остановился, постоял минуту, а затем проехал этот светофор со скоростью 5 км/ч. Идущий следом грузовой поезд №2001 остановился у предыдущего светофора №5 с запрещающим показанием (из-за занятого блок-участка между светофорами № 3 и 5), а после минутной остановки также продолжил движение, проехав светофор с красным огнём и следуя на хвост №2003.
За поездом №2001 в свою очередь в 03:16 из Гардабани был отправлен почтово-багажный поезд №905 сообщением Тбилиси-Баку. Он состоял из 10 почтово-багажных вагонов и дополнительно прицепленных в хвосте 10 пассажирских вагонов (по неподтвержденным данным в них находились призывники, направляющиеся к месту службы). После остановки у светофора №5 с запрещающим показанием машинист почтово-багажного поезда отпустил тормоза и продолжил движение со скоростью 18 км/ч, а затем остановился примерно в 80 метрах от хвоста стоящего перед ним поезда №2001, при этом хвост самого поезда №905 оказался в 112 метрах за светофором №5. Фактически теперь на перегоне оказались сразу три поезда, расположенные следом друг за другом: № 2003, 2001 и 905; два последних находились на одном блок-участке.
В 03:25 из Гардабани следом за почтово-багажным поездом был отправлен грузовой №2005. Когда грузовой поезд проехал проходной светофор №7 с желтым огнем, на локомотивном светофоре показание сменилось с "Ж" на "КЖ", предупреждая, что на расположенном впереди светофоре №5 горит красный сигнал. Также автостоп выдал звуковой сигнал предупреждения, на что машинист отреагировал нажатием на рукоятку бдительности, однако скорость поезда при этом не снижалась. Впоследствии экспертиза пришла к заключению, что локомотивная бригада поезда №2005 на самом деле спала, а на рукоятку бдительности машинист нажимал "на автомате". В 03:30 фактически неуправляемый грузовой поезд №2005 проехал светофор №5 с запрещающим показанием и через несколько секунд на скорости 50 км/ч врезался в почтово-багажный №905, смяв находящиеся у того в хвосте пассажирские вагоны.
В происшествии по имеющимся данным погибли 32 человека: локомотивная бригада поезда № 2005 и 30 пассажиров поезда № 905.

Причиной крушения следственная комиссия назвала сон локомотивной бригады поезда №2005, хотя она работала всего 5 часов 5 минут, а перед этим имела достаточный отдых. После проезда светофора с запрещающим показанием автостоп не успел бы не то что остановить поезд, но и даже применить экстренное торможение. Дело в том, что из-за некоторой "инерционности" он срабатывает примерно через 12 секунд, чтобы в случае сбоя локомотивная бригада успела исправить ситуацию. В данном случае расстояние от светофора до почтово-багажного поезда составляло всего 112 метров, на преодоление которых грузовому поезду понадобилось примерно 6 секунд.